Nuevas herramientas para explotar el genoma

Transcurrido un tiempo de la secuenciación del genoma humano, apenas progresa su aplicación en la práctica clínica. El desarrollo de herramientas para sistematizar su estudio es el reto al que se enfrenta la ciencia.

La aplicación de la genómica en la práctica de la medicina es un tema tan complejo como desafiante. Transcurrido un año del anuncio de la secuenciación completa del genoma humano, los prometidos frutos de la secuencia, tales como "balas mágicas", medicina a la carta o predicción de la enfermedad en fases asintomáticas, continúan estando lejanos y pasan por el desarrollo de herramientas que conviertan el código obtenido en datos útiles y accesibles a cualquier médico, según se destaca en una revisión sobre el tema publicada por la revista Nature.Concluida la anotación del genoma, el siguiente paso consiste en generar nuevas herramientas que permitan localizar en él la información con valor médico. Para David Bentley, del Instituto Wellcome Trust Sanger, en Cambridge (Reino Unido), "necesitamos obtener una anotación de alta calidad de todas las secuencias funcionalmente importantes y de las alteraciones asociadas a la enfermedad. Para lograrlo, se requieren más secuencias genómicas, análisis sistemáticos y mayor información de los fenotipos humanos".
Poco a poco se va disponiendo de tecnología capaz de definir sistemáticamente múltiples biomarcadores en muestras biológicas, lo que permite analizar todos los productos del genoma a nivel proteico o de ARN mensajero y encontrar marcadores pronósticos. "Los patrones de ARNm son potentes marcadores pronósticos en cáncer y pueden emplearse para definir subtipos de enfermedad y predecir la respuesta terapéutica", comenta John Bell, de la Universidad de Oxford, en otro artículo recogido en la revisión.

La disponibilidad de estas técnicas de cribaje masivo facilitará la identificación de los polimorfismos que caracterizan las enfermedades complejas. Hasta ahora en estos estudios se había empleado la técnica de conexión genética, pero las nuevas tecnologías han permitido la realización de estudios de asociación del genoma completo. No obstante, previamente estos estudios de asociación han de superar un buen número de retos, incluyendo problemas con el diseño de los test múltiples y los ensayos.
Cuando estas herramientas alcancen la madurez, completarán el conocimiento de las patologías mendelianas y proporcionarán información sobre las vías genéticas que intervienen en la patogénesis.

El estudio en el genoma de la patología humana no debe desdeñar la epigenética, que se refiere a los cambios en la expresión genética adquiridos durante el desarrollo. La alteración del equilibrio de las redes epigenéticas puede provocar patologías como el cáncer o síndromes que implican inestabilidad genética.

Por todo ello, el desarrollo de terapias epigenéticas resulta prometedor. De momento, varios inhibidores de enzimas que controlan las modificaciones epigenéticas, específicamente las metiltransferasas de ADN y las histonas deacetilasas, han mostrado efectos antitumorigénicos en algunas enfermedades.

Fuente: Nature 2004; 429: 439-481

Año V, N° 97, Agosto 2004